202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0184 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0184  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  100 
 
 
272 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0197  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  98.9 
 
 
272 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.302585  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3373  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  92.28 
 
 
272 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209215  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2837  flagellar biosynthesis protein, FlhG  92.65 
 
 
272 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0270  flagellar biosynthesis protein, FlhG  92.65 
 
 
272 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0252  flagellar biosynthesisprotein, FlhG  92.65 
 
 
272 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0178  flagellar biosynthesis protein, FlhG  84.62 
 
 
273 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2844  flagellar biosynthesis protein FlhG, putative  74.63 
 
 
270 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0060  flagellar biosynthesis protein FlhG  74.63 
 
 
270 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3167  flagellar biosynthesis protein FlhG, putative  75.37 
 
 
270 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3420  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  74.63 
 
 
270 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1698  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  74.63 
 
 
270 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3841  putative flagellar protein  74.63 
 
 
270 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3922  putative flagellar protein  74.63 
 
 
270 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3131  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  74.63 
 
 
270 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2961  flagellar biosynthesis protein FlhG  60.08 
 
 
293 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.0900625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3801  flagellar biosynthesis protein FlhG  57.26 
 
 
275 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0133  flagellar biosynthesis protein FlhG  56.91 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4143  flagellar biosynthesis protein FlhG  40.75 
 
 
300 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5618  flagellar biosynthesis protein FlhG  36.68 
 
 
264 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81162  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3701  flagellar biosynthesis protein FlhG  40.86 
 
 
274 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216726  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0742  putative MinD-related protein  32.73 
 
 
296 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.27 
 
 
299 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.7 
 
 
293 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  30.36 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  30.82 
 
 
295 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  31.05 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000517997  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  30.47 
 
 
313 aa  95.5  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.07 
 
 
293 aa  92.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3765  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.07 
 
 
306 aa  92  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  28.57 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  30.8 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3849  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.02 
 
 
306 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000469993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1248  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  31.71 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  25.27 
 
 
289 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  25.27 
 
 
289 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  31.17 
 
 
280 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1312  putative MinD-related protein  30.91 
 
 
309 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3031  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.47 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.35 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.29 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.62 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.29 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.29 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.99 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.29 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  28.69 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02871  flagellar biosynthetic protein FlhG  29.43 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742055  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  26.37 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.4 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.87 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 
311 aa  79  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 
303 aa  79  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_003296  RS02067  hypothetical protein  30.71 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.51 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.76 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  28.24 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  30.82 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  30.82 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.84 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  30.82 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  30.82 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.82 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  31.37 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.82 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.82 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.82 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.82 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4181  hypothetical protein  30.25 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4069  hypothetical protein  30.25 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150148  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.29 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.79 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.9 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.71 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.53 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1671  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.74 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.14 
 
 
290 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0896  septum site-determining protein MinD  27.68 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.015324  hitchhiker  0.00397046 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  18.55 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2024  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.1 
 
 
277 aa  62.4  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.9 
 
 
333 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>