29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1660 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  100 
 
 		 316 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  43.6 
 
 		 513 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  46.88 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  36.65 
 
 		 549 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  35.4 
 
 		 482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  34.39 
 
 		 775 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  34.38 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  29.95 
 
 		 553 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  34.78 
 
 		 489 aa  89.4  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  31.25 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2477  hypothetical protein  38.93 
 
 		 439 aa  82.4  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00283932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  32.05 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1526 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0751  hypothetical protein  24.76 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0674  hypothetical protein  32.8 
 
 		 183 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1149 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  28.69 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  27.39 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  29.87 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  29.71 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  28.75 
 
 		 830 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  28.85 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  29.51 
 
 		 900 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  26.61 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  28.24 
 
 		 859 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  28.1 
 
 		 992 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1046 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  26.85 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6381  hypothetical protein  27.89 
 
 		 414 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>