13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2788 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  100 
 
 		 489 aa  1013    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  36.62 
 
 		 482 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  36.03 
 
 		 553 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  39.2 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2477  hypothetical protein  25.77 
 
 		 439 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00283932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  33.17 
 
 		 513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  33.53 
 
 		 549 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  32.53 
 
 		 290 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  34.78 
 
 		 316 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  33.13 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  32.39 
 
 		 775 aa  84  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  25.61 
 
 		 311 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0751  hypothetical protein  30.59 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.309445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>