18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1857 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  1001    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  38.91 
 
 		 553 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  37.06 
 
 		 489 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  28.47 
 
 		 398 aa  195  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2477  hypothetical protein  43.56 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00283932  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  36.97 
 
 		 290 aa  130  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  37.22 
 
 		 549 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  40.38 
 
 		 513 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  35.4 
 
 		 316 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  37.16 
 
 		 775 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  29.74 
 
 		 324 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4263  hypothetical protein  26.51 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.294762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0751  hypothetical protein  31.21 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1149 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  25.9 
 
 		 314 aa  57  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  27.81 
 
 		 293 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  23.78 
 
 		 311 aa  53.5  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  24.39 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>