15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1816 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  811    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  28.18 
 
 
482 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  28.39 
 
 
553 aa  186  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  39.2 
 
 
489 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2477  hypothetical protein  39.62 
 
 
439 aa  136  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00283932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  39.35 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  37.5 
 
 
549 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  31.77 
 
 
290 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  34.38 
 
 
316 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  35.1 
 
 
775 aa  93.6  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  28.3 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  32.3 
 
 
830 aa  56.6  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  27.44 
 
 
1149 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  25 
 
 
293 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  24.24 
 
 
527 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>