13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2477 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2477  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  896    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00283932  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  39.62 
 
 		 398 aa  136  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  43.56 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  25.77 
 
 		 489 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  25.1 
 
 		 553 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  37.34 
 
 		 513 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  30.46 
 
 		 290 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  34.1 
 
 		 549 aa  83.2  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  38.93 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  29.27 
 
 		 775 aa  79.7  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  31.14 
 
 		 1149 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  29.81 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  24.44 
 
 		 527 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>