14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3997 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  100 
 
 		 293 aa  600  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  38.79 
 
 		 527 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1149 aa  89  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  34.9 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1046 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  30.67 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  28.66 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  28.69 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  27.81 
 
 		 482 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  29.27 
 
 		 775 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4984  hypothetical protein  28.57 
 
 		 552 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  26.26 
 
 		 830 aa  45.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  24.71 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>