14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6381 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6381  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  860    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5725  hypothetical protein  30.77 
 
 		 509 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7956  hypothetical protein  31.58 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0599296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00346684  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0514  hypothetical protein  28.42 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591074  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  30 
 
 		 633 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4259  hypothetical protein  33.93 
 
 		 847 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178114  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2024  TIR protein  29.29 
 
 		 163 aa  57  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2652  hypothetical protein  27.72 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.909396  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  34.86 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0094  TIR protein  35.56 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2651  hypothetical protein  26.04 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468315  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1510  hypothetical protein  31.37 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  31.87 
 
 		 249 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>