21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3546 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  79.39 
 
 		 233 aa  217  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  80.15 
 
 		 239 aa  215  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  76.92 
 
 		 227 aa  207  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  75.57 
 
 		 233 aa  202  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  72.52 
 
 		 242 aa  195  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  69.47 
 
 		 234 aa  194  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  68.7 
 
 		 243 aa  188  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  67.18 
 
 		 231 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  32.84 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  28.57 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  30.88 
 
 		 299 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  27.41 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  32.09 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  32.09 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  30.94 
 
 		 275 aa  67  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  31.09 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  32.29 
 
 		 413 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 		 1363 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  28.57 
 
 		 1048 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5111  hypothetical protein  28.24 
 
 		 251 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.370649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>