41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2310 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  42.41 
 
 		 275 aa  221  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  36.84 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  53.09 
 
 		 255 aa  175  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  54.89 
 
 		 541 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  51.91 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  51.91 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  31.58 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4885  hypothetical protein  42.11 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  30.72 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  31.39 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2265  hypothetical protein  42.11 
 
 		 101 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.310683  normal  0.0284056 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  30.88 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2592  hypothetical protein  51.52 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  30.88 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  31.62 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  30.41 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  30.53 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  28.15 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 1526 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  38.2 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  32.09 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  29.73 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  38 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  35.16 
 
 		 1611 aa  55.8  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  36.26 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  31.18 
 
 		 404 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33 
 
 		 441 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  33 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1624  TIR protein  31.58 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2207  hypothetical protein  31.07 
 
 		 401 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  36.99 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  31.06 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  32.99 
 
 		 279 aa  46.2  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  32.97 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1298  ankyrin  32 
 
 		 797 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  27.73 
 
 		 969 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  26.36 
 
 		 1373 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  29.9 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  29.87 
 
 		 357 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>