16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3771 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3771  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  780    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3578  hypothetical protein  46.49 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4229  hypothetical protein  46.75 
 
 		 387 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2916  hypothetical protein  54.1 
 
 		 272 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1272  hypothetical protein  38.96 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2635  hypothetical protein  37.73 
 
 		 380 aa  262  8e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0162237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4260  hypothetical protein  38.01 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0534  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.656053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  35.06 
 
 		 797 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4744  hypothetical protein  28.92 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  36 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  31.71 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3047  hypothetical protein  32.18 
 
 		 292 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1323  hypothetical protein  31.43 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  27.36 
 
 		 255 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  28.15 
 
 		 584 aa  42.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>