33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3187 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 674 aa  1362    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.74 
 
 		 648 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1052 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1214  hypothetical protein  53.09 
 
 		 219 aa  200  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.384546  hitchhiker  0.00043991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0547  TPR repeat-containing protein  50.25 
 
 		 211 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  29.27 
 
 		 441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  28.81 
 
 		 441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  29.1 
 
 		 423 aa  112  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  32 
 
 		 389 aa  101  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  36.92 
 
 		 668 aa  89.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  32.5 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  28.48 
 
 		 797 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  40.8 
 
 		 260 aa  75.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  32.21 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  31.19 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  23.8 
 
 		 450 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  34 
 
 		 306 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2095  hypothetical protein  30.93 
 
 		 450 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000101265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 908 aa  50.8  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.737617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  30.25 
 
 		 257 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  31.78 
 
 		 321 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  29.06 
 
 		 280 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 657 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 		 1979 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  31.53 
 
 		 287 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  32.39 
 
 		 240 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1463  hypothetical protein  27.62 
 
 		 635 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4489 aa  45.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2636  putative adenylate/guanylate cyclase  29.13 
 
 		 611 aa  45.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.416157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 744 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 250 aa  43.9  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>