20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2837 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  35.29 
 
 		 329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  30.77 
 
 		 244 aa  85.9  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  27.59 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  31.82 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  25.57 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 648 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1052 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  24.23 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  23.85 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1966  hypothetical protein  27.33 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  22.58 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  29.6 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 674 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  28.09 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  23.81 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  31.03 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  22.83 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>