23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0445 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  873    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  32.08 
 
 
441 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  30.67 
 
 
441 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
674 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  26.86 
 
 
1052 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  36.31 
 
 
389 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 
648 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  39.66 
 
 
260 aa  86.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  31.47 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  27.37 
 
 
668 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  34.23 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  40.82 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2095  hypothetical protein  39.8 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000101265 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  25.57 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  34.23 
 
 
277 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  33.67 
 
 
306 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  28.8 
 
 
280 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  31.07 
 
 
280 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  32.63 
 
 
207 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
451 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  26.89 
 
 
257 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  28.28 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0257  hypothetical protein  28.47 
 
 
908 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.737617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>