22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2513 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  100 
 
 		 668 aa  1302    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  33.99 
 
 		 441 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  33.5 
 
 		 441 aa  127  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 674 aa  100  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 		 648 aa  97.8  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1052 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  28.61 
 
 		 450 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  27.37 
 
 		 423 aa  88.2  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2095  hypothetical protein  28.12 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000101265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  37.07 
 
 		 260 aa  79.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  32.3 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  35 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  21.12 
 
 		 451 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  36.67 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  30.51 
 
 		 287 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  30.91 
 
 		 280 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  27.87 
 
 		 257 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0796  hypothetical protein  35.04 
 
 		 492 aa  48.9  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  30.53 
 
 		 280 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  27.14 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  30.04 
 
 		 2159 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>