13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2095 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  94.22 
 
 		 450 aa  844    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2095  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  893    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000101265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  46.12 
 
 		 441 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  46.12 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  26.87 
 
 		 668 aa  76.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1052 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  39.8 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  34 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 674 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  32.52 
 
 		 260 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 		 648 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  26.09 
 
 		 244 aa  47.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0796  hypothetical protein  34.31 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>