24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2231 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  894    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  98.87 
 
 
441 aa  882    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  47.76 
 
 
450 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2095  hypothetical protein  45.5 
 
 
450 aa  353  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000101265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  28.26 
 
 
1052 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 
648 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  30.67 
 
 
423 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  33.5 
 
 
668 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 
674 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  34.39 
 
 
389 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  37.39 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  34.33 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  36.07 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  24.23 
 
 
321 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 
451 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  31.4 
 
 
287 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  25.17 
 
 
280 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  31.58 
 
 
277 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  26.12 
 
 
306 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1440  RNA binding S1 domain protein  27.59 
 
 
460 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0770116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  24.58 
 
 
257 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  32.08 
 
 
252 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  25.62 
 
 
280 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>