15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2123 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  894    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2095  hypothetical protein  94.22 
 
 		 450 aa  819    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000101265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  47.76 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  47.76 
 
 		 441 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1052 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  28.61 
 
 		 668 aa  80.1  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  33.04 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  40.82 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.21 
 
 		 648 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  32.52 
 
 		 260 aa  53.9  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 674 aa  53.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  26.62 
 
 		 244 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  28.68 
 
 		 277 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0796  hypothetical protein  33.58 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  26.79 
 
 		 329 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>