25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0546 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  39.66 
 
 		 423 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  39.29 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  37.39 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  37.93 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  35.33 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  32.76 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.05 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  40.8 
 
 		 674 aa  75.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  42.19 
 
 		 1052 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  35.83 
 
 		 668 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  31.5 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  34.74 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  32 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  33.71 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  34.26 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  32.52 
 
 		 450 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2095  hypothetical protein  32.52 
 
 		 450 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000101265 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  30.3 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  26.4 
 
 		 158 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1274  hypothetical protein  25.69 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67051e-21 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0257  hypothetical protein  37.1 
 
 		 908 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.737617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  26.32 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.62351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>