25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2748 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  42.31 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  40 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  42.95 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  42.59 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  46.08 
 
 		 207 aa  96.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  34.96 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  30 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  31.5 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  30.4 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1052 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  35.71 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  34.19 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.19 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 674 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  26.57 
 
 		 441 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  31.07 
 
 		 423 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1274  hypothetical protein  28.23 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67051e-21 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  31.09 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  25.17 
 
 		 441 aa  53.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  22.58 
 
 		 321 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  29.41 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1966  hypothetical protein  26.79 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  26.56 
 
 		 872 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0277  hypothetical protein  23.53 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>