26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2662 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  36.15 
 
 		 252 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  38.76 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  37.93 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  30 
 
 		 280 aa  70.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  34.07 
 
 		 441 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  31.54 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  33.83 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  30.88 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  68.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  33.64 
 
 		 306 aa  61.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  33.06 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1274  hypothetical protein  30.95 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67051e-21 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  36.59 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 648 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  28.47 
 
 		 389 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  31.18 
 
 		 329 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  26.4 
 
 		 260 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  29.41 
 
 		 321 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1463  hypothetical protein  37.78 
 
 		 635 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1966  hypothetical protein  35.29 
 
 		 387 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1052 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  28.57 
 
 		 423 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0940  molydopterin dinucleotide-binding region  32.95 
 
 		 308 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0198973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1411  hypothetical protein  26.53 
 
 		 305 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000180028  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0277  hypothetical protein  30.85 
 
 		 286 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>