15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1274 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1274  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67051e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1411  hypothetical protein  32.67 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000180028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0940  molydopterin dinucleotide-binding region  28.84 
 
 		 308 aa  89.4  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0198973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  35.24 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  35.78 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  30.23 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  30.95 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1966  hypothetical protein  40 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  28.23 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  30 
 
 		 277 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  27.37 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  30.97 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  25.69 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  25.49 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  29.52 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>