31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2788 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  504  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  38.52 
 
 
280 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  39.13 
 
 
257 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  34.96 
 
 
280 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  36.29 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  29.07 
 
 
329 aa  92.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  39.34 
 
 
389 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  41.9 
 
 
287 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  30.77 
 
 
321 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  34.96 
 
 
277 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  32.76 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  38.76 
 
 
158 aa  82  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  35.25 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
674 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  34.33 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  33.09 
 
 
1052 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  31.47 
 
 
423 aa  78.6  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.61 
 
 
648 aa  78.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  34.38 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  39.29 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  31.58 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0257  hypothetical protein  30 
 
 
908 aa  55.1  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.737617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  30 
 
 
668 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
451 aa  52.4  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  26.62 
 
 
450 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2095  hypothetical protein  26.09 
 
 
450 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000101265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1274  hypothetical protein  25.49 
 
 
300 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67051e-21 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1966  hypothetical protein  32.38 
 
 
387 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455462  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0940  molydopterin dinucleotide-binding region  30.59 
 
 
308 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0198973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1463  hypothetical protein  27.37 
 
 
635 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1411  hypothetical protein  22.95 
 
 
305 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000180028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>