18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2319 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1411  hypothetical protein  37.16 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000180028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  38.46 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  37.93 
 
 
158 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0940  molydopterin dinucleotide-binding region  33.14 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0198973 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1274  hypothetical protein  35.78 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67051e-21 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  31.58 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  32.48 
 
 
277 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  29.41 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  34.18 
 
 
329 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  26.56 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1966  hypothetical protein  23.76 
 
 
387 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  27.97 
 
 
389 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  27.83 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  26.35 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  24.67 
 
 
280 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  26.32 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 
648 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>