26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4997 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  42.31 
 
 		 280 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  41.73 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  42.37 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  46.67 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  46.36 
 
 		 207 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  41.9 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  30.88 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7318  FRG domain-containing protein  29.24 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614163  normal  0.0703577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  32 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1052 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  34.71 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  31.4 
 
 		 441 aa  55.8  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  31.4 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  31.43 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  27.94 
 
 		 329 aa  52.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.19 
 
 		 648 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  30.51 
 
 		 668 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  28.28 
 
 		 423 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  26.35 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 674 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  29.84 
 
 		 389 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1274  hypothetical protein  29.52 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67051e-21 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0277  hypothetical protein  23.9 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  22.83 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0731  hypothetical protein  27.4 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>