41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7318 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7318  FRG domain-containing protein  100 
 
 		 433 aa  897    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614163  normal  0.0703577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1569  FRG domain protein  36.88 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0788051  hitchhiker  0.000961497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2822  FRG domain protein  37.35 
 
 		 427 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.008437  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2606  hypothetical protein  36.9 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2429  hypothetical protein  37.36 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395939  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2167  hypothetical protein  43.88 
 
 		 111 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0123  FRG domain-containing protein  34.17 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1726  FRG domain protein  39.32 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.344355  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0446  FRG domain-containing protein  25.45 
 
 		 519 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0137329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1265  hypothetical protein  38.84 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12500  FRG domain protein  39.25 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.777002 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1265  FRG domain protein  27.82 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000623383  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0731  hypothetical protein  34.85 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1025  FRG domain-containing protein  25.33 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.763332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  29.24 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4251  FRG domain protein  25.67 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.537216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3474  FRG domain-containing protein  36.36 
 
 		 229 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000141197  hitchhiker  0.00000902439 
 
 
-
 
NC_004310  BR0735  hypothetical protein  38.83 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2997  hypothetical protein  38.78 
 
 		 119 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0513  FRG domain protein  31.16 
 
 		 243 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.145455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5513  FRG domain-containing protein  23.84 
 
 		 247 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936719  normal  0.420266 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0609  FRG domain protein  24.54 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2511  FRG domain protein  47.06 
 
 		 262 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.674893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1407  hypothetical protein  32.48 
 
 		 277 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870046  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5068  FRG domain-containing protein  22.79 
 
 		 270 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3159  hypothetical protein  22.79 
 
 		 270 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2922  hypothetical protein  23.83 
 
 		 261 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2571  hypothetical protein  24.63 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5209  hypothetical protein  22.79 
 
 		 270 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4039  FRG domain protein  33 
 
 		 209 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0436  FRG domain protein  23.08 
 
 		 265 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1048  hypothetical protein  34.41 
 
 		 273 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1361  blue (type1) copper domain-containing protein  29.31 
 
 		 270 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0510  hypothetical protein  26.15 
 
 		 301 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.95152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0332  FRG domain-containing protein  33.33 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6897  hypothetical protein  22.5 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0661  hypothetical protein  60.61 
 
 		 280 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1120  FRG domain protein  22.71 
 
 		 238 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4159  FRG domain protein  22.56 
 
 		 275 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3768  FRG domain protein  67.86 
 
 		 264 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3852  FRG domain protein  67.86 
 
 		 264 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000680889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>