22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2745 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  36.15 
 
 		 158 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1274  hypothetical protein  35.24 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67051e-21 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  34.38 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1411  hypothetical protein  27.7 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000180028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0940  molydopterin dinucleotide-binding region  31.03 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0198973 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  32.76 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  30.4 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  29.81 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  34.38 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  32.54 
 
 		 389 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  30.11 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  34.26 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  31.43 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  32.18 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  29.6 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  30.3 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1966  hypothetical protein  34.88 
 
 		 387 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455462  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  33.02 
 
 		 441 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  32.08 
 
 		 441 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.9 
 
 		 648 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>