11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1966 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1966  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455462  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1274  hypothetical protein  40 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67051e-21 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  27.33 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2319  hypothetical protein  23.76 
 
 		 304 aa  50.4  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.62351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2745  hypothetical protein  34.88 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00183256  hitchhiker  0.0000580838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  26.79 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  30.95 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  32.38 
 
 		 244 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  32.89 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4195  purine phosphorylase family 1  25.29 
 
 		 508 aa  43.1  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>