17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3110 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411546  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1733  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.09 
 
 
643 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635761  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  35.65 
 
 
1392 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  41.84 
 
 
1308 aa  121  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  36.6 
 
 
1766 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2530  hypothetical protein  29.68 
 
 
521 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0400  hypothetical protein  28.25 
 
 
318 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4519  hypothetical protein  30.15 
 
 
311 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 
1491 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6430  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
998 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  30.16 
 
 
797 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5277  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic contain C-terminal PDZ domain-like protein  23.81 
 
 
425 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2004  hypothetical protein  26.89 
 
 
1166 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.731586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  30.69 
 
 
677 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3713  hypothetical protein  21.62 
 
 
307 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554135  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1343  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  27.1 
 
 
536 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.937553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3056  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
1021 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>