152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1261 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 
301 aa  590  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  47.53 
 
 
203 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  35.16 
 
 
192 aa  123  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  33.33 
 
 
183 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  32.24 
 
 
183 aa  99  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  32.24 
 
 
183 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  32.16 
 
 
189 aa  95.5  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1867  beta-lactamase domain protein  47.06 
 
 
477 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0121854 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  37.76 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3773  hypothetical protein  44 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0715  hypothetical protein  42.99 
 
 
149 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.100612  normal  0.0883598 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0606  competence-like protein  38.71 
 
 
140 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.216559  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  36.5 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  33.16 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.92 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02760  hypothetical protein  34.78 
 
 
164 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29947  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  27.64 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  46.43 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  30.81 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  34.76 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.62 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  34.52 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  34.13 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  33.33 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0008  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.82 
 
 
398 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.203843  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  30.77 
 
 
388 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  33.73 
 
 
350 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  30.07 
 
 
156 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  31.96 
 
 
372 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2842  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.65 
 
 
416 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0933431  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  40.23 
 
 
479 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  28.1 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.72 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  29.38 
 
 
169 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.02 
 
 
179 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  26.54 
 
 
227 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1905  hypothetical protein  38.82 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  36.94 
 
 
175 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.19 
 
 
183 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  36.55 
 
 
161 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  27.52 
 
 
214 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  36.42 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  27.52 
 
 
214 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  32.3 
 
 
191 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30.14 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30.14 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  32.47 
 
 
180 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.87 
 
 
171 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  38.13 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  25.63 
 
 
199 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  27.42 
 
 
227 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  29.3 
 
 
237 aa  55.8  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  35.11 
 
 
1931 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.46 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  28.93 
 
 
153 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.56 
 
 
153 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  35.81 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  38.06 
 
 
170 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  25.75 
 
 
206 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4471  hypothetical protein  30.19 
 
 
155 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  25.25 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  38.13 
 
 
214 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  29.41 
 
 
214 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.13 
 
 
158 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  24.84 
 
 
175 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  38.13 
 
 
226 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  32.97 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  30.16 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  33.74 
 
 
190 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  32.93 
 
 
162 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  26.25 
 
 
148 aa  53.5  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  26.74 
 
 
164 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  24.68 
 
 
175 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  37.01 
 
 
273 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  30.85 
 
 
222 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  24.05 
 
 
175 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  29.89 
 
 
175 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  27.57 
 
 
178 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  36.3 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  31.1 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  31.94 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  30.2 
 
 
150 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  34.07 
 
 
382 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  27.78 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  30.82 
 
 
171 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  30.52 
 
 
190 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  30.52 
 
 
190 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  29.66 
 
 
209 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7022  hypothetical protein  31.9 
 
 
158 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  33.13 
 
 
272 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  24.87 
 
 
249 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  33.33 
 
 
231 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  30.91 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  26.62 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  26.85 
 
 
192 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  28.57 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  25.27 
 
 
171 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  31.98 
 
 
178 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  26.32 
 
 
232 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  39.05 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>