190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3744 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  63.79 
 
 
187 aa  236  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  59.32 
 
 
179 aa  224  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  63.16 
 
 
158 aa  207  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  53.14 
 
 
180 aa  197  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  45.09 
 
 
171 aa  150  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  46.39 
 
 
169 aa  144  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  41.85 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  42.11 
 
 
193 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  49.31 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  44.44 
 
 
185 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  44.83 
 
 
171 aa  121  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  35 
 
 
232 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  36.3 
 
 
238 aa  104  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  38.73 
 
 
192 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  35.12 
 
 
185 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  32 
 
 
244 aa  101  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  37.25 
 
 
183 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  37.91 
 
 
193 aa  98.6  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  38 
 
 
148 aa  98.6  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  34.66 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  40.52 
 
 
162 aa  95.1  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  39.33 
 
 
182 aa  94.4  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  34.27 
 
 
227 aa  94.4  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  38 
 
 
226 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  35.1 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  34.44 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.86 
 
 
174 aa  92  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  33.77 
 
 
175 aa  91.3  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  32.94 
 
 
227 aa  90.9  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  35.62 
 
 
221 aa  87.8  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  36.73 
 
 
196 aa  87.4  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  35.22 
 
 
166 aa  87.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  38.36 
 
 
150 aa  87  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.18 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  34.18 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  34.09 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  34.25 
 
 
221 aa  85.9  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  35.42 
 
 
216 aa  85.5  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  32.73 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  36.57 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  36.49 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  34.66 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  33.33 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  38.36 
 
 
153 aa  82  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  42.38 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  36 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  29.71 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  35.15 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  31.41 
 
 
233 aa  79  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  30.07 
 
 
161 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30.81 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  26.67 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  34.42 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.28 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  31.98 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  31.64 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  34.01 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  29.89 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  36.3 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  31.52 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  35.56 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  35.56 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  35.29 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.29 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  28.95 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  32.67 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  32.67 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  34.81 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31.94 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  30.14 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  31.79 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  34.27 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  35.67 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  30.64 
 
 
278 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  34.27 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  28.9 
 
 
166 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  33.57 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.45 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  32.89 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  27.84 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  28.11 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  32.24 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  32.24 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  31.29 
 
 
228 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  28.8 
 
 
282 aa  63.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  26.51 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  30.06 
 
 
168 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  28.99 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  31.76 
 
 
266 aa  61.2  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  30.68 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 
226 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 
271 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  33.33 
 
 
136 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.31 
 
 
350 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  33.95 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  30.07 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  26.17 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  32.64 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>