147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04500 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 
276 aa  564  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  38.82 
 
 
266 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  50 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  46.53 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  47.45 
 
 
271 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  45.38 
 
 
178 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  42.36 
 
 
190 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  42.36 
 
 
190 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  38.38 
 
 
218 aa  105  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  47.06 
 
 
258 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  40.77 
 
 
260 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  44.44 
 
 
180 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  42 
 
 
351 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  42.74 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  39.01 
 
 
222 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  38.78 
 
 
190 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  41.48 
 
 
346 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  32.22 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  46.6 
 
 
374 aa  92  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  31.11 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  38.57 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  31.07 
 
 
255 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  42.52 
 
 
191 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  36.17 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  32.96 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  37.5 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  26.52 
 
 
266 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  38.73 
 
 
372 aa  85.5  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  35.21 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  33.54 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  38.89 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  27.94 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  40.62 
 
 
175 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  32.19 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  34.93 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  32.43 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  34.25 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  33.15 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  33.7 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  33.53 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  37.01 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  25.63 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  41.79 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  27.54 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  32.61 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30.77 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  36.09 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  36.09 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  36.92 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  44.86 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  36.22 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  36.22 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  30.51 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  32.61 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  38.46 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  34.62 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  36.43 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  44.86 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  41.84 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  37.5 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  37.3 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.02 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  26.32 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  25.4 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  35.79 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  35.33 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  27.78 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  26.49 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  32.63 
 
 
240 aa  62.4  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  31.94 
 
 
189 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  26.2 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  40.17 
 
 
203 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  32.31 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  25.38 
 
 
262 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  27.4 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4243  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  30.3 
 
 
713 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  0.0150792 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  31.75 
 
 
153 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  34.04 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.75 
 
 
153 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0612  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  55.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.5 
 
 
186 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  40.86 
 
 
170 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  25.35 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0596  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 
700 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.673642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  37.89 
 
 
124 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  24.67 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  27.15 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  30.53 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  35.35 
 
 
214 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  35.96 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  29.79 
 
 
187 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  32.58 
 
 
388 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf871  nuclease, lipoprotein  27.56 
 
 
234 aa  50.8  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.87 
 
 
171 aa  48.9  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  33.66 
 
 
178 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.33 
 
 
214 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  29.45 
 
 
238 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  27.96 
 
 
192 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>