153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0516 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  100 
 
 
189 aa  380  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  68.57 
 
 
183 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  66.12 
 
 
183 aa  244  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  67.43 
 
 
183 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  54.49 
 
 
192 aa  191  7e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  31.95 
 
 
301 aa  93.2  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  32.34 
 
 
258 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  28.22 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  28.28 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  30.56 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  30.56 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  29.3 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  29.3 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  29.3 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  32 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  32 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  29.73 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  30.26 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  27.85 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  27.85 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  27.81 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  24.83 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.92 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  26.2 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  31.82 
 
 
382 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  28 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  29.03 
 
 
327 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  28.12 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  26.52 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  31.94 
 
 
276 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  31.94 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  26.4 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.33 
 
 
153 aa  62  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  29.66 
 
 
286 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  23.5 
 
 
222 aa  61.6  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  29.03 
 
 
271 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  27.85 
 
 
237 aa  60.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.26 
 
 
238 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  27.04 
 
 
209 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  28.02 
 
 
169 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  27.22 
 
 
266 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  29.17 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  26.57 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  28.1 
 
 
408 aa  58.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  27.7 
 
 
346 aa  57.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  31.45 
 
 
175 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  29.25 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  29.79 
 
 
231 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  27.53 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  29.25 
 
 
284 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  23.76 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.87 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  29.76 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  26.83 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  26.63 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  24.31 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  27.97 
 
 
257 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  26.46 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  24.86 
 
 
175 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.51 
 
 
206 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  24.28 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  28.02 
 
 
278 aa  54.7  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  27.27 
 
 
351 aa  54.7  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0407  nuclease (SNase-like)  27.74 
 
 
308 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  25.3 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  28.07 
 
 
374 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.25 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  26.35 
 
 
216 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  24.28 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  24.19 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  23.16 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  26.32 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  29.27 
 
 
227 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  24.83 
 
 
350 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  27.54 
 
 
161 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  27.5 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  26.9 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  28.21 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  26.17 
 
 
171 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  28.97 
 
 
161 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  29.17 
 
 
153 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  28.08 
 
 
186 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  25.68 
 
 
218 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  24.67 
 
 
372 aa  51.6  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  25.52 
 
 
148 aa  51.2  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  28.37 
 
 
227 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  26.76 
 
 
169 aa  51.2  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  32.65 
 
 
170 aa  51.2  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  28.37 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  26.97 
 
 
142 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  29.08 
 
 
227 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  26.71 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  26.97 
 
 
249 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  24.66 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  25 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  22.35 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  26.8 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  25.68 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  27.78 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  26.9 
 
 
534 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>