169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0779 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 
169 aa  343  5e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  39.22 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  38.89 
 
 
238 aa  114  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  36.42 
 
 
153 aa  111  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.42 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  37.66 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  34.09 
 
 
244 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  32.58 
 
 
232 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  34.21 
 
 
153 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  35.03 
 
 
227 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  37.88 
 
 
153 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  35.82 
 
 
196 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  31.87 
 
 
206 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  36.14 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.52 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  33.54 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  31.03 
 
 
184 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  38.51 
 
 
193 aa  95.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  35.03 
 
 
221 aa  95.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.93 
 
 
171 aa  94  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  36.17 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  32.3 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  32.93 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  30.72 
 
 
216 aa  92.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  31.76 
 
 
171 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  35.38 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  36.11 
 
 
148 aa  92  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  33.96 
 
 
192 aa  91.3  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  32.5 
 
 
205 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  33.11 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  33.12 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.43 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  32.69 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32.43 
 
 
175 aa  89  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  37.66 
 
 
185 aa  87.8  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  33.77 
 
 
225 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  34.21 
 
 
233 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  34.44 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.17 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  35.66 
 
 
199 aa  85.1  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  34.86 
 
 
194 aa  84.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.61 
 
 
153 aa  85.1  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  36.5 
 
 
138 aa  84.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  37.5 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  33.83 
 
 
150 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.18 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  32.05 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  29.71 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  27.45 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  30.41 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  31.45 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  30.2 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  35.62 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  29.19 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  37.4 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  35 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  31.85 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  32.95 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  34.85 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  31.06 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  33.33 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  32.06 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  38.19 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  32.64 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  32.26 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  30.63 
 
 
226 aa  63.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  36.29 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  36.29 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  33.74 
 
 
227 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  33.74 
 
 
227 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  30.88 
 
 
200 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  28.3 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  27.43 
 
 
192 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  33.1 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  32.43 
 
 
155 aa  61.6  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  31.54 
 
 
175 aa  61.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  34.59 
 
 
161 aa  61.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  31.88 
 
 
171 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  31.88 
 
 
171 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.19 
 
 
221 aa  60.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  30.99 
 
 
388 aa  60.8  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  25.86 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  29.38 
 
 
301 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  30.26 
 
 
228 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  25.31 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  24.86 
 
 
205 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30.07 
 
 
158 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  30.57 
 
 
189 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  34.03 
 
 
240 aa  57.4  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  28.47 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  32.26 
 
 
266 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  31.09 
 
 
259 aa  57.4  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  29.37 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  34.68 
 
 
214 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  33.81 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  30.88 
 
 
272 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  28.19 
 
 
212 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  28.06 
 
 
197 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  29.47 
 
 
115 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>