159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0371 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  100 
 
 		 350 aa  714    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  64.4 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  60.7 
 
 		 374 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  45.33 
 
 		 258 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  39.71 
 
 		 190 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  39.71 
 
 		 190 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  49.61 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  38.52 
 
 		 178 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  40 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  31.18 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  41.1 
 
 		 180 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  39.04 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  34.5 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  41.61 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  47.73 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  43.85 
 
 		 259 aa  94.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  39.87 
 
 		 200 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  38.32 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  38.89 
 
 		 276 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  32.41 
 
 		 192 aa  89.7  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  37.59 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  36.71 
 
 		 190 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  30.57 
 
 		 214 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  36.09 
 
 		 209 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  38.31 
 
 		 175 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  29.8 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  29.8 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  39.86 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  38.89 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  39.39 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  34.9 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  31.45 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  31.45 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  33.14 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  34.08 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  33.53 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  31.68 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  29.73 
 
 		 183 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  40.43 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  32.58 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  37.16 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  28.03 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.82 
 
 		 169 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.33 
 
 		 174 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  34.06 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  33.55 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  34.88 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0120  nuclease  34.48 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  28.57 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.31 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  37.59 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  37.78 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  28.43 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  36.22 
 
 		 153 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  34.97 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  28.38 
 
 		 183 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  32.93 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  31.21 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  36.15 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  33.33 
 
 		 180 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  31.78 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  30.83 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  32.81 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  33.9 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  35.25 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  32.81 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  31.62 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  31.85 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  31.01 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  31.01 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  37.98 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  27.67 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  34.03 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  35.29 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  34.62 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  30.07 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.84 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  32.33 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.78 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  24.83 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  40.86 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  29.2 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.78 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  29.93 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  34.35 
 
 		 191 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  31.58 
 
 		 171 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.91 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.12 
 
 		 169 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  34.07 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  29.13 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  34.33 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  32.82 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  31.06 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  29.21 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  33.59 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  33.59 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  29.2 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  31.06 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  31.62 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>