107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1371 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  41.87 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  42.25 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  42.31 
 
 		 333 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  40.98 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  36.96 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  32.99 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  31.9 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  30.93 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  36.72 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  34.38 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  31.55 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  29.79 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  32.52 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.97 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  28.38 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  28.23 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  28.23 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  31.85 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  34.4 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  27.89 
 
 		 327 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  23.19 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  30.08 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  33.61 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  33.33 
 
 		 346 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  30.08 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  32.14 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  34.15 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.37 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  28.23 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  29.53 
 
 		 276 aa  52.4  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  28.89 
 
 		 186 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30.36 
 
 		 185 aa  51.6  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  33.06 
 
 		 153 aa  52  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  31.82 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  36.56 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  30.94 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  28.72 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  29.81 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  28.73 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  29.49 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  34.11 
 
 		 388 aa  49.3  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  32.54 
 
 		 169 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  28.08 
 
 		 183 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.57 
 
 		 175 aa  48.5  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  29.7 
 
 		 164 aa  48.5  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  30.36 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.98 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  30 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.98 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  31.58 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  30.95 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.72 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  27.4 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  33.07 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  30.66 
 
 		 172 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  29.75 
 
 		 166 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  29.36 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  29.63 
 
 		 187 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.99 
 
 		 153 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.86 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  28.81 
 
 		 124 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 301 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.84 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  28.35 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  28.35 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  36.46 
 
 		 374 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  27.08 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  31.15 
 
 		 286 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  26.71 
 
 		 183 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  30.69 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  26.53 
 
 		 158 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  34.67 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30.33 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.59 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  36.36 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  32.58 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  29.03 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  26.98 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  30.58 
 
 		 175 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  39.6 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  33.61 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  29.92 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  33.83 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.65 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  34.48 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  30 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  34.48 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  30.65 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30.85 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  26.95 
 
 		 169 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  27.83 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  30.88 
 
 		 148 aa  42.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  24.14 
 
 		 244 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 		 162 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  29.51 
 
 		 174 aa  42.4  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  30.93 
 
 		 201 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>