104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3775 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3775  nuclease  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  61.02 
 
 		 256 aa  321  6e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  60.42 
 
 		 286 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  36.95 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  29.96 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  30.36 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  28.02 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  28.44 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  27.75 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  31.61 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  26.39 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  27.94 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  30.05 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  27.07 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  27.47 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  27.43 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  32.22 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  26.48 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  27.8 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  26.86 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  29.41 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  32.62 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  26.86 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  32.87 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.14 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.14 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  31.65 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  29.45 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  35.34 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  34.88 
 
 		 184 aa  62  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  30.08 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34.38 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  29.32 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  29.32 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  32.84 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  32.84 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  34.31 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  27.78 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  32.59 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  32.81 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  34.07 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.97 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  33.54 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  29.37 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  26.04 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  28.57 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  30.07 
 
 		 351 aa  55.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  29.37 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  38.4 
 
 		 148 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  23.17 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32.28 
 
 		 153 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  38.46 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  33.07 
 
 		 408 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.06 
 
 		 174 aa  52.4  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  25 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  25.16 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  31.85 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  29.11 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  30.34 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  32.37 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  32.06 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  25 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  29.49 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  35.45 
 
 		 197 aa  49.3  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  27.74 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  25.68 
 
 		 534 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  31.01 
 
 		 175 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  24.36 
 
 		 175 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  30.14 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  32.06 
 
 		 382 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  31.68 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  24.26 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  30.32 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  32.81 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  28.57 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  26.92 
 
 		 358 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  30.4 
 
 		 153 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  30.4 
 
 		 153 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  26.25 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  29.17 
 
 		 201 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  34.06 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  26.25 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  25.82 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  27.76 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  31.96 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  28.07 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  31.16 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  27.94 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  29.22 
 
 		 383 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2380  nuclease (SNase domain protein)  25.77 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00295748  normal  0.102212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  33.33 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  28.26 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  31.16 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  30.65 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  30.3 
 
 		 189 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  29.1 
 
 		 162 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  30.3 
 
 		 189 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  34.21 
 
 		 324 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>