106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1691 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1691  nuclease  100 
 
 		 272 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  39.32 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  36.08 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  34.1 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3161  nuclease  30.98 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  32.2 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  33.21 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  35.14 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  35.38 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  30.88 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  32.71 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2232  SNase-like nuclease  31.82 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  30.39 
 
 		 255 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  31.87 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  30.04 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  31.66 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  31.67 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  30.68 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1361  nuclease (SNase domain protein)  29.88 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.048766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  31.52 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3304  hypothetical protein  30.16 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.293773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  29.05 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  28.12 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  30.33 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3627  hypothetical protein  29.76 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  0.3305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  31.28 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  30.22 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  30.22 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  32.45 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  27.9 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  38.28 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  25.4 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  34.07 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  31.07 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5911  hypothetical protein  35.59 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00689412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  33.83 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  34.56 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  33.76 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3504  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  34.39 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.14 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  27.81 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  27.81 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  33.59 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  30.88 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  27.2 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  35.61 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  34.13 
 
 		 155 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  27.54 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  29.9 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  29.01 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  28.97 
 
 		 157 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  34.78 
 
 		 180 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  30.43 
 
 		 157 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  34.97 
 
 		 158 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  33.82 
 
 		 200 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.7 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4491  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.54 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  26.94 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  23.31 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  38.14 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  30.72 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  33.8 
 
 		 187 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  29.37 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  34.69 
 
 		 201 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  28.87 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  28.73 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  37.31 
 
 		 169 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.88 
 
 		 388 aa  48.9  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  35.11 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5286  hypothetical protein  40.45 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  31.85 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  25.43 
 
 		 189 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  25 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  25.2 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  29.1 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.06 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  31.3 
 
 		 185 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.74 
 
 		 174 aa  46.2  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  30.29 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  31.11 
 
 		 202 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  32.84 
 
 		 185 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  26.99 
 
 		 187 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  28.67 
 
 		 180 aa  45.8  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  33.08 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  29.01 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  33.08 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  29.58 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  29.33 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  31.3 
 
 		 172 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  26.35 
 
 		 192 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.15 
 
 		 166 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  27.37 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  30.88 
 
 		 153 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  31.78 
 
 		 195 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>