209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1061 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  98.29 
 
 		 175 aa  352  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  98.29 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  47.67 
 
 		 174 aa  157  8e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  45.04 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  37.58 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  37.5 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  36.75 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  35.54 
 
 		 232 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  37.75 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.42 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  38.51 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  41.18 
 
 		 238 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  38.89 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  35.33 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  33.54 
 
 		 244 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  36.99 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  39.39 
 
 		 157 aa  98.6  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  35.8 
 
 		 227 aa  97.8  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  35.11 
 
 		 153 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  34.9 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  31.29 
 
 		 216 aa  94  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  32.7 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  35.62 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  33.11 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.89 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  30.99 
 
 		 221 aa  92  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  30.99 
 
 		 187 aa  91.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  36.42 
 
 		 171 aa  91.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  33.77 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.67 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.39 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  31.18 
 
 		 228 aa  89  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.43 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.41 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  26.9 
 
 		 221 aa  87.8  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  32.19 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  34.39 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  36.3 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  32.03 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  29.34 
 
 		 185 aa  85.1  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  28.31 
 
 		 171 aa  85.1  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  31.06 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  31.34 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  30.72 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.54 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  29.27 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  30.61 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  34.06 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  30.6 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  31.36 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  30.49 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  32.92 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  33.83 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.28 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  33.08 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  29.12 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  32.39 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  31.85 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  34.92 
 
 		 214 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  34.13 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  28.49 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  27.44 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  28.48 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  36.5 
 
 		 534 aa  74.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31.61 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  32.84 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  31.11 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  31.82 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  29.87 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  31.78 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.11 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  30.14 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  32.03 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  26.28 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  28.95 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  28.95 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  32.65 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  31.93 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  28.83 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  29.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  27.78 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  34.59 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  29.83 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  33.98 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.79 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  32.8 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 241 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  33.86 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  30.63 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  35.29 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  27.65 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  30.6 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  31.76 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  31.3 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  29.07 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  32.39 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  28.85 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>