141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2433 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  100 
 
 		 170 aa  341  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  37.58 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  43.94 
 
 		 284 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  36.81 
 
 		 263 aa  74.7  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.54 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  37.11 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  31.52 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  30.27 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  38.06 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  32.6 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  34.27 
 
 		 333 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  30.39 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  29.53 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  32.75 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  32.65 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  36.09 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  31.47 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.38 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  28.12 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  33.33 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  35.67 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  31.47 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  32.32 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  32.18 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.72 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  34.01 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  36.36 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  32.17 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  33.54 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  27.66 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  31.85 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  34.75 
 
 		 372 aa  57.8  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  36.75 
 
 		 350 aa  57.4  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  31.11 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  31.11 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  35.88 
 
 		 273 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  31.47 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  31.47 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  33.08 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  31.1 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  34.09 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  35.9 
 
 		 346 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.72 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  31.61 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  35.17 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  30.3 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  35.66 
 
 		 258 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  34.68 
 
 		 374 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  34.75 
 
 		 286 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  32.89 
 
 		 327 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  35.37 
 
 		 255 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  33.8 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  32.91 
 
 		 260 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  24.86 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30.36 
 
 		 256 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  36.88 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  27.56 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  29.14 
 
 		 238 aa  52  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  34.23 
 
 		 267 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.97 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  34.69 
 
 		 273 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  43.66 
 
 		 274 aa  51.2  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.01 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  26.79 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  36.99 
 
 		 200 aa  50.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  34.31 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  33.11 
 
 		 183 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  28.57 
 
 		 237 aa  50.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  29.65 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.19 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  33.85 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  38.85 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  32.37 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.19 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  32.64 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  27.71 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  31.54 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  26.25 
 
 		 169 aa  49.3  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  28.82 
 
 		 249 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  30.82 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  25.93 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  35.47 
 
 		 273 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  31.25 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  27.11 
 
 		 232 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  29.24 
 
 		 227 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  30.06 
 
 		 255 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  33.1 
 
 		 221 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  31.91 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  29.17 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  29.25 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.31 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  32.69 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.85 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  31.29 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  31.85 
 
 		 227 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>