222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0051 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 		 148 aa  300  3.0000000000000004e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  43.84 
 
 		 232 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  43.79 
 
 		 244 aa  124  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  45.52 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  41.72 
 
 		 174 aa  121  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  45.04 
 
 		 175 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  45.04 
 
 		 175 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  44.27 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  41.77 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  44 
 
 		 221 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  38.22 
 
 		 227 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  42.31 
 
 		 238 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  42.36 
 
 		 221 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  42.21 
 
 		 185 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  42.45 
 
 		 199 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  38.12 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  45.59 
 
 		 182 aa  110  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  46.88 
 
 		 192 aa  110  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  46.21 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  36.77 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  39.57 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  36.77 
 
 		 225 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  39.57 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  40.54 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  40.94 
 
 		 216 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  42.75 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  37.72 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  40.71 
 
 		 206 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  38.36 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  42.18 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  40.6 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  43.08 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  40.65 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  39.73 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  40.14 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  37.43 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  40.71 
 
 		 187 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  36.69 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  43.38 
 
 		 175 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  39.44 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  37.69 
 
 		 184 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  41.73 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  38 
 
 		 183 aa  98.6  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  46.56 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  37.42 
 
 		 226 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  39.1 
 
 		 196 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  38.57 
 
 		 169 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  41.35 
 
 		 208 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  36 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  36.99 
 
 		 193 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  35.57 
 
 		 185 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  36.11 
 
 		 169 aa  92  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  35.81 
 
 		 194 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  37.12 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  33.12 
 
 		 227 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  36.72 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  32.65 
 
 		 191 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  34.68 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  36.5 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  37.86 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  36.55 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  31.97 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  38.17 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  35.77 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  32.91 
 
 		 227 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  32.91 
 
 		 227 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  35.17 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  34.72 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  35.43 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  34.62 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  32.09 
 
 		 212 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  33.08 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  34.65 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  35.46 
 
 		 534 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  34.51 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.97 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  31.13 
 
 		 195 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  36.57 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  35.25 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  29.87 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.77 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.95 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  27.84 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  31.85 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  31.85 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  32.31 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  32.67 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  29.75 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  34.62 
 
 		 189 aa  67  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  34.62 
 
 		 189 aa  67  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  32.26 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  31.67 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  31.11 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  34.81 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  32.33 
 
 		 258 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  38.89 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  31.17 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  32.58 
 
 		 241 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 202 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  33.6 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>