153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0952 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  100 
 
 
157 aa  323  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  53.91 
 
 
228 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  44.83 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  44.67 
 
 
156 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  42.75 
 
 
216 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  40.99 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  41.67 
 
 
232 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  42.31 
 
 
153 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  41.1 
 
 
175 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  41.25 
 
 
164 aa  113  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  41.91 
 
 
150 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  41.55 
 
 
191 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  39.73 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  39.88 
 
 
175 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  41.35 
 
 
153 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  40.51 
 
 
225 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  41.3 
 
 
153 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  37.25 
 
 
244 aa  103  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  43.7 
 
 
196 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  39.73 
 
 
148 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  37.25 
 
 
174 aa  101  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  36.84 
 
 
238 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  38.51 
 
 
227 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  40.91 
 
 
175 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  40.15 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  37.24 
 
 
153 aa  99  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  39.39 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  38.71 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  37.8 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  38 
 
 
185 aa  97.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  38.57 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  36.17 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  35.33 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  39.84 
 
 
169 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  40.44 
 
 
208 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  36.36 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  36.49 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  37.31 
 
 
221 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  36.57 
 
 
221 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  34.57 
 
 
171 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  35.95 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  30.57 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  34.53 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  36.18 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  33.79 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.97 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  33.56 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  35.42 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  34.09 
 
 
192 aa  80.5  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  33.13 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  36.43 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  34.25 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  33.33 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  29.68 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.48 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  30.72 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  38.81 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.41 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  35.04 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  38.24 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  34.48 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  34.07 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  34.81 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.79 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  35.82 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  32.26 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  31.06 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  29.7 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  31.29 
 
 
227 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  33.75 
 
 
202 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  35.77 
 
 
214 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  28.15 
 
 
388 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  36.84 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  31.88 
 
 
168 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  33.33 
 
 
212 aa  61.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.9 
 
 
183 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.84 
 
 
221 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  29.55 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  32.86 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  35.07 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.33 
 
 
214 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  34.11 
 
 
226 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  31.54 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.17 
 
 
211 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  29.71 
 
 
226 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  30.43 
 
 
272 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  30.08 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  30.93 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  33.08 
 
 
192 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  30.57 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  30.08 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  32.84 
 
 
227 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  35.56 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  32.09 
 
 
227 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  26.04 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  32.09 
 
 
227 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.67 
 
 
192 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  28.91 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>