140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15970 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  100 
 
 		 388 aa  761    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  42.31 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  36.89 
 
 		 227 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  39.02 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  36.89 
 
 		 227 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  35.87 
 
 		 227 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  33.72 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.63 
 
 		 214 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.19 
 
 		 226 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  39.13 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  29.45 
 
 		 192 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  32.89 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  33.04 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.61 
 
 		 238 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  29.24 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  29.13 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  28.12 
 
 		 242 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  36.17 
 
 		 196 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  27.55 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  36.8 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  34.03 
 
 		 231 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  26.1 
 
 		 241 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1898  hypothetical protein  57.89 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131013  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.93 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.78 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.65 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.57 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0394  hypothetical protein  55.17 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  31.79 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.78 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  28.07 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  28.76 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  26.85 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  26.67 
 
 		 183 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  24.83 
 
 		 189 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  34.85 
 
 		 200 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  30.63 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  30.63 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  31.16 
 
 		 214 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  32.81 
 
 		 191 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  34.11 
 
 		 153 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  31.47 
 
 		 244 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  33.83 
 
 		 153 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  31.16 
 
 		 214 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  29.37 
 
 		 216 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  35.77 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  31.16 
 
 		 214 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  33.83 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  44.68 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  28.89 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  33.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  33.97 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  31.45 
 
 		 162 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  31.82 
 
 		 166 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0407  nuclease (SNase-like)  31.47 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  33.81 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  33.8 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  29.72 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6887  hypothetical protein  62.5 
 
 		 110 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  27.56 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  32.31 
 
 		 178 aa  57  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  33.33 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  35.86 
 
 		 175 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.56 
 
 		 156 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  28.17 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  30.14 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  37.25 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  28.03 
 
 		 227 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  26.87 
 
 		 233 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  27.69 
 
 		 148 aa  55.8  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  33.12 
 
 		 164 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  32.26 
 
 		 153 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  30.77 
 
 		 190 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  30.77 
 
 		 190 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  33.07 
 
 		 227 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  31.78 
 
 		 212 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.25 
 
 		 209 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  42.67 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2574  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000152958  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  32.14 
 
 		 187 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  35.61 
 
 		 218 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  29.79 
 
 		 183 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  24.09 
 
 		 192 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5111  hypothetical protein  47.92 
 
 		 89 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0927764  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  30.5 
 
 		 161 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0120  nuclease  29.84 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  28.87 
 
 		 284 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.69 
 
 		 157 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  28.92 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  29.55 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  42.86 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  23.67 
 
 		 247 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  29.05 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  41.03 
 
 		 205 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  27.86 
 
 		 161 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  32.84 
 
 		 231 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2313  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  33.88 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>