139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2456 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 240 aa  483  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  39.72 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  42.05 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  36.8 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  39.04 
 
 		 333 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  33.01 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  30.26 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  31.53 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  29.38 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  30.25 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  28.14 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.65 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  40.15 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  32.03 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.97 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  31.46 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  32.63 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  37.25 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  32.12 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.28 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  41.96 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  33.07 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  32.73 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  40.17 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  35.95 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  40.17 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  37.23 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  41.58 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  34.95 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  39.52 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  35.94 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  37.59 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  32.64 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  31.45 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  33.33 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  30.71 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  34.03 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  30.13 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  33.79 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.43 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  31.45 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  36.29 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  33.98 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  36.67 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  38.24 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  34.86 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  35.43 
 
 		 171 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  29.9 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  26.01 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  35.76 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.52 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  30.91 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  32.64 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  31.01 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  35.87 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.56 
 
 		 148 aa  52.8  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  31.78 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  35.94 
 
 		 182 aa  53.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  34.53 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  32.61 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  34.65 
 
 		 166 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  28.57 
 
 		 178 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  34.86 
 
 		 187 aa  52.4  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  36.17 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  27.48 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  27.48 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.54 
 
 		 175 aa  52  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  29.46 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  34.69 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.81 
 
 		 175 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.81 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  35.59 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  36.22 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  30.4 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.83 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  29.77 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  31.15 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2030  nuclease  39.84 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000391548 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  29.7 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  31.74 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  38.03 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  33.06 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  32.82 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  36.17 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  37.96 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  34.13 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  37.63 
 
 		 136 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  41.24 
 
 		 169 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  39.39 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  37.76 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.49 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 169 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  32.69 
 
 		 155 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  26.37 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  30.87 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  37.89 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  34.27 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>