110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2838 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2838  nuclease  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  36.8 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  38.1 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  34.69 
 
 		 256 aa  144  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  30.13 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  32.16 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  30.04 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  30.23 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  28.46 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  33.66 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  30.04 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  35.08 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  29.08 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  28.92 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  28.06 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  28.38 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  31.18 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  25.63 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  29.38 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  29.89 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  29.19 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  33.85 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  30.63 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  31.07 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  32.39 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  27.54 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  30.88 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  34.38 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  37.4 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  34.38 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  34.38 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  30.88 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  30.88 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  32.03 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  29.25 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  27.62 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  25.78 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  31.34 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  29.63 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  30.3 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  29.63 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  32.59 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  31.16 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30.83 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30.83 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.82 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  30.47 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  27.01 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  26.51 
 
 		 164 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  30.37 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  32.28 
 
 		 185 aa  52.4  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  28.31 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  31.87 
 
 		 301 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  33.06 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.81 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.47 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  31.45 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  29.01 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  24.55 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  29.13 
 
 		 388 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  31.15 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  34.34 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  27.87 
 
 		 534 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  24.29 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  30.59 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  33.33 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  28.36 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  28.46 
 
 		 333 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  36.17 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  25.43 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  26.11 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  33.01 
 
 		 124 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  25 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  27.21 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  28.67 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30.22 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  32.31 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  28.37 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  27.54 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  30.95 
 
 		 372 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  29.63 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.17 
 
 		 157 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  28.69 
 
 		 197 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  26.77 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  30.06 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  26.7 
 
 		 171 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.74 
 
 		 180 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  29.32 
 
 		 191 aa  45.8  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  35.11 
 
 		 200 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  22.81 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  26.35 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2380  nuclease (SNase domain protein)  24.89 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00295748  normal  0.102212 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  26.09 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3161  nuclease  24.05 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  32.76 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  26.98 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  28.4 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  29.94 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>