128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0755 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  100 
 
 
166 aa  343  8.999999999999999e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  50.31 
 
 
249 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  47.77 
 
 
197 aa  141  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  35.66 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  35.77 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  35.77 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  31.01 
 
 
351 aa  78.2  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  34.87 
 
 
237 aa  77.8  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  36.55 
 
 
199 aa  77.4  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  33.59 
 
 
266 aa  74.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  32.41 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  32.5 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  31.87 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  33.08 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  34.62 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  27.78 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  35.46 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.63 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  35.16 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  35.48 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.26 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  32.39 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  27.84 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  36.97 
 
 
284 aa  60.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.17 
 
 
171 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.87 
 
 
174 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  31.62 
 
 
227 aa  60.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  33.33 
 
 
231 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  33.09 
 
 
200 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  34.94 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.33 
 
 
187 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  34.17 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.61 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  31.78 
 
 
190 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  27.71 
 
 
185 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  30.15 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.85 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  31.3 
 
 
222 aa  54.7  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  32.87 
 
 
214 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.26 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  31.58 
 
 
187 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  26.47 
 
 
238 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  32.17 
 
 
226 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  27.46 
 
 
244 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  25.93 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  27.1 
 
 
220 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  31.33 
 
 
273 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  30.3 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  30.5 
 
 
227 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  27.63 
 
 
169 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  29.01 
 
 
260 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  28.86 
 
 
408 aa  51.2  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 
382 aa  51.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30.13 
 
 
180 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  28.83 
 
 
171 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  31.62 
 
 
350 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  24.32 
 
 
192 aa  50.8  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  23.78 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  32.85 
 
 
273 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  29.32 
 
 
293 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  29.55 
 
 
214 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  26.28 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  30.6 
 
 
346 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  33.33 
 
 
374 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  30.14 
 
 
286 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  27.74 
 
 
257 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  27.61 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  29.55 
 
 
214 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  26.28 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  28.15 
 
 
266 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  29.92 
 
 
259 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  30.37 
 
 
333 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  33.12 
 
 
273 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  26.03 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  23.78 
 
 
183 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  26.79 
 
 
136 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.77 
 
 
153 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  29.85 
 
 
372 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  30.77 
 
 
214 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  25 
 
 
183 aa  47.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  25.58 
 
 
182 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  27.94 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  32.12 
 
 
255 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  27.27 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  29.25 
 
 
267 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  31.43 
 
 
324 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  25 
 
 
256 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  31.39 
 
 
255 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  30.77 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  33.04 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  29.08 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  27.86 
 
 
232 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  26.35 
 
 
247 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.04 
 
 
446 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  28.07 
 
 
278 aa  45.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  27.74 
 
 
301 aa  45.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  28 
 
 
311 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>