148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2093 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  35.32 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  36.5 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  34.6 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  34.57 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  35.06 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  34.01 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  34.22 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  34.69 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  32.71 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  32.69 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  36.4 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  29.07 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  32.13 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  28.38 
 
 		 247 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  28.57 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  30.36 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  27.89 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  27.94 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  31.21 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  30.68 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  30.5 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  26.67 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  31.08 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.85 
 
 		 186 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  33.33 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  33.33 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  33.56 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  28.93 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  24.71 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  28.48 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.2 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  27.64 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  35.51 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  30.64 
 
 		 183 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.35 
 
 		 187 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  34.25 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  34.25 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  32.68 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  31.98 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.56 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  28.39 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  30.73 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  36.72 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  35.82 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  30.73 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  30.14 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  33.02 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  29.36 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.08 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  34.86 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  29.3 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  31.72 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  28.65 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  29.74 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.39 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  29.45 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  30.07 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  37.62 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  30.04 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  32.89 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  28.65 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.58 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.97 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30.49 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  29.07 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  29.45 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  31.91 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.58 
 
 		 175 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  31.65 
 
 		 158 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  29.73 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.22 
 
 		 175 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  26.58 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.75 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  29.93 
 
 		 169 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  29.61 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  28.11 
 
 		 183 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  31.54 
 
 		 157 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  27.04 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  31.39 
 
 		 162 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  34.53 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  27.83 
 
 		 197 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  27.85 
 
 		 163 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30 
 
 		 185 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  30.99 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  35.38 
 
 		 136 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  35.71 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  47.62 
 
 		 171 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  35.92 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  26.32 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  32.65 
 
 		 170 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  29.24 
 
 		 195 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  32.59 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  32.95 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  26.7 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  27.34 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  32.82 
 
 		 155 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  32.32 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>