53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2850 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 
311 aa  648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  65.57 
 
 
293 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  36.05 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  36.05 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  35.33 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  35.77 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  30.39 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  36.42 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  37.1 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  35.66 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  30.2 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  30.2 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  45.12 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  29.3 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  32.28 
 
 
180 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  35.16 
 
 
408 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  35.11 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  29.07 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.06 
 
 
238 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  27.62 
 
 
271 aa  62.4  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  32.24 
 
 
200 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  32.06 
 
 
218 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  35.66 
 
 
214 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  33.87 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  31.03 
 
 
161 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  34.88 
 
 
214 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  34.88 
 
 
214 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  29.33 
 
 
175 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  37.11 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  25.33 
 
 
374 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  32 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.45 
 
 
192 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  39.77 
 
 
214 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  26.47 
 
 
187 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.54 
 
 
174 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  24.32 
 
 
153 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  24.18 
 
 
184 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  25.34 
 
 
180 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  26.21 
 
 
166 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  32.38 
 
 
115 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  26.09 
 
 
183 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  33.68 
 
 
157 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  29.37 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  26.67 
 
 
166 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  36.08 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  28 
 
 
166 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  25.33 
 
 
185 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  31.68 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  29.81 
 
 
197 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  30.08 
 
 
203 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  25.6 
 
 
183 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  22.39 
 
 
189 aa  42.7  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>