127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0402 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  67.31 
 
 		 267 aa  359  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  62.26 
 
 		 273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  66.12 
 
 		 247 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  61.09 
 
 		 273 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  61.87 
 
 		 266 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  59.53 
 
 		 273 aa  321  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  59.2 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  56.97 
 
 		 255 aa  291  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  55.56 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  36.5 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  36.78 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  38.32 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  28.46 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  24.9 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  28.69 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  26.99 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  29.23 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  29.05 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  30.29 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  33.83 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  33.83 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  26.15 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  28.78 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  32.19 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  33.8 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  29.05 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  40.3 
 
 		 175 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  30.53 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  35.61 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  33.33 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  34 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  35.81 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  30.13 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  32.82 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  36.3 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  34.33 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  32.65 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  26.74 
 
 		 351 aa  62  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  29.86 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  30.86 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  26.32 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  32.64 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  36.43 
 
 		 136 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  31.88 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  36.22 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  30.36 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  27.73 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  30.15 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.82 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.47 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.52 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30.41 
 
 		 185 aa  55.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  25.93 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  32.14 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  29.02 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  29.75 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  29.36 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  34.38 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  35.51 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf871  nuclease, lipoprotein  25.95 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  29.41 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  32.82 
 
 		 169 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  25.17 
 
 		 183 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  32.1 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  30.91 
 
 		 374 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  28.66 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0612  hypothetical protein  30.82 
 
 		 176 aa  52.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  31.48 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  29.01 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  33.1 
 
 		 187 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  28.45 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  30.3 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  32.61 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30.2 
 
 		 158 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.65 
 
 		 388 aa  48.9  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  34 
 
 		 162 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  24.83 
 
 		 183 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  25.68 
 
 		 183 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  31.16 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  32.74 
 
 		 124 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  28.14 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  33.33 
 
 		 185 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  28.99 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.45 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  32.03 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  28.14 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  31.3 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  31.01 
 
 		 408 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  35.19 
 
 		 382 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.11 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  29.2 
 
 		 164 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  28.99 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  29.13 
 
 		 153 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  29.22 
 
 		 274 aa  45.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  32.1 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>