131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0060 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  100 
 
 		 351 aa  712    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  57.52 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  52.35 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  48.77 
 
 		 271 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  50.36 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  37.93 
 
 		 190 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  37.93 
 
 		 190 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  42 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  39.26 
 
 		 178 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  38.56 
 
 		 180 aa  97.8  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  39.57 
 
 		 191 aa  89.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  34.39 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  33.81 
 
 		 175 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  34.93 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  31.01 
 
 		 166 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  38.81 
 
 		 174 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  35.62 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  34.29 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  32.08 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  29.68 
 
 		 222 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  32.61 
 
 		 190 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.81 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  32.65 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  31.72 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  34.55 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  31.65 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  28.74 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  30.41 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  30.71 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1300  hypothetical protein  40.43 
 
 		 193 aa  67  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  34.51 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  29.28 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.39 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  32.45 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  32.17 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  29.11 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.85 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  28.47 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  26.74 
 
 		 260 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  31.43 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  31.61 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  28.89 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  28.48 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  28.48 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  29.8 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  26.63 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  30.14 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  35.19 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.3 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  32.87 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.07 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  26.74 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0901  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  27.37 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1455  hypothetical protein  44.23 
 
 		 253 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.463604  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  30.37 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  28.39 
 
 		 183 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  30.07 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.27 
 
 		 189 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  27.56 
 
 		 183 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.6 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  27.34 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  31.11 
 
 		 244 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  29.85 
 
 		 175 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  29.79 
 
 		 228 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  29.79 
 
 		 228 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  27.1 
 
 		 183 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  26.12 
 
 		 153 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  29.85 
 
 		 175 aa  53.1  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  29.2 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  28.67 
 
 		 231 aa  52.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  26.12 
 
 		 153 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  43.48 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  26.76 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  30.32 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.34 
 
 		 171 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  25.64 
 
 		 187 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  27.94 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  27.21 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06680  hypothetical protein  48.98 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000220571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  29.93 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0502  hypothetical protein  39.58 
 
 		 77 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1415  hypothetical protein  43.75 
 
 		 103 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  28.81 
 
 		 171 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  26.28 
 
 		 255 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  25.35 
 
 		 164 aa  49.7  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  28.99 
 
 		 184 aa  49.7  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.47 
 
 		 179 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  25.47 
 
 		 255 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  31.62 
 
 		 184 aa  48.9  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  39.58 
 
 		 216 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  29.52 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  27.61 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  25 
 
 		 191 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1274  nuclease  34.04 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  29.2 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  25.55 
 
 		 156 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  33.7 
 
 		 115 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  29.36 
 
 		 231 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  37.04 
 
 		 214 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>